المجزرة أثارت ردود فعل من الحكومة السودانية والأحزاب والرأي العام، خاصة أنها جاءت بالتزامن مع زيارة قائد قوات الدعم السريع، الفريق أول محمد حمدان دقلو "حميدتي" إلى العاصمة التشادية أنجامينا، حيث التقى برئيس المجلس العسكري التشادي "محمد إدريس ديبي".

مؤخرا دعت واشنطن لنشر قوات حفظ الأمن في إقليم دارفور المضطرب، في تحد واضح لمجلس السيادة، وتجاهل لخلافاته مع البعثة الأممية "يونيتامس"، وقد انحاز البيت الأبيض للأخيرة، ووصل الحال إلى توجيه تهديدات صريحة للبرهان. 

البرهان، عين محمد حمدان دقلو نائبا له، وضم لعضوية المجلس، شمس الدين كباشي، وياسر العطا، وإبراهيم جابر، ومالك عقار اير، والهادي إدريس، والطاهر حجر، ورجاء نيكولا، ويوسف جاد كريم، وأبو القاسم محمد أحمد، وعبد الباقي عبد القادر الزبير، وسلمي عبد الجبار".

قوات المجلس العسكري شنت حملة اعتقالات واسعة طالت شخصيات سياسية وزعامات حزبية سودانية، وأطلقت الرصاص على الحشود الشعبية ومواقع تجمعات الثوار في أنحاء متفرقة من العاصمة ومدن أخرى، مما أسفر عن وقوع 4 قتلى و80 مصاباً -بحسب لجنة أطباء السودان-.

بعد سقوط رئيس النظام السوداني عمر البشير، التزم الجيش السوداني بتسليم السلطة للمدنيين، الذين يكافحون من أجل تنظيم المرحلة الانتقالية، لكن الوقائع على الأرض تشير إلى صعوبة ذلك.